«Корабль призраков» разворачивается на реально существующем океанском лайнере «Королева Мэри», навсегда пришвартованном в Лонг-Бич и известном своими мрачными легендами. История начинается, когда маленький Лукас с мамой приезжают на это судно, ныне служащее музейом и развлекательным центром. Пока мама отвлекается, любознательный ребёнок таинственно исчезает в лабиринтах палуб и коридоров.
Джейн, женщина за сорок, наконец-то чувствует, что набрала высоту. После болезненного развода она не только удержала процветающую пекарню — своё детище и источник стабильности, — но и встретила нового мужчину, с которым строит лёгкие, безоблачные отношения. Кажется, что хаос прошлого позади, и будущее предстаёт спокойным и предсказуемым.