В небольшом прибрежном городке, готовящемся к празднованию Дня независимости, разворачивается необъяснимая и ужасающая трагедия. Источником бедствия становится залив, вода в котором после сброса отходов куриной фермы превращается в рассадник опасных мутировавших паразитов. Эти организмы быстро находят путь в человеческий организм, вызывая мучительную и смертельную трансформацию.
После событий первого фильма стая доисторических пиранх находит новый путь к жертвам — через городскую канализацию и водопроводные сети. Они проникают в «Wilderness Waters», огромный аквапарк, который только открывается для посетителей. Здесь, среди водных горок, волновых бассейнов и детских зон, начинается отчаянная борьба за выживание.