Действие разворачивается в 1997 году, где прошлое сталкивается с будущим. Из апокалиптического времени приходит специальный агент — женщина-солдат, чья миссия критически важна: защитить Малкольма Ли, гениального учёного, стоящего на пороге создания искусственного интеллекта. Этот ИИ станет последней надеждой человечества в предстоящей войне с Скайнетом.
Перед нами — юный Арсен Люпен III, ещё не знаменитый грабитель, а обычный старшеклассник из богатой семьи, задыхающийся от скуки и предсказуемости жизни в Токио. Его мир переворачивается с головы на ноги после случайной встречи в ночном клубе с загадочным и безразличным к окружающим Джигеном Дайске, виртуозным стрелком, который сразу видит в Люпене лишь избалованного аристократа.
Действие разворачивается в тихом приморском городке Японии, куда молодой человек по имени Иори Китахара приезжает учиться в университет. Он снимает комнату в доме семьи Котэгава, чей отец владеет магазином снаряжения для дайвинга. Парадокс в том, что сама тема моря и подводных глубин абсолютно чужда Иори — он страдает от сильной гидрофобии, и близость воды вызывает у него панический ужас.
В этом аниме-сериале внутренний мир человека предстаёт как ожившая мегаполис, где 37 триллионов клеток ежедневно выполняют свою работу. Главная героиня — рассеянная и добродушная эритроцит AE3803, которая только начинает свою карьеру по доставке кислорода. Её напарником и защитником становится хладнокровный и эффективный нейтрофил U-1146, для которого битва с патогенами — routine.