Действие разворачивается в густонаселённом жилом массиве Токио, где переезжает главный герой — молодой человек, надеявшийся найти в мегаполисе новую жизнь. Его жильём становится тесная, полуразрушенная коммуналка, кажется, застывшая во времени. Соседи — странные, молчаливые личности, чьи привычки и взгляды вызывают смущение и нарастающую тревогу.
Главный герой, Акира, год назад с блестящими надеждами начал карьеру офисного планктона, но быстро превратился в зомбиоподобное существо, затерянное в бесконечных переработках и тирании начальства. Мысль о суициде становится его единственным способом побега, пока однажды Токио не охватывает настоящий зомби-апокалипсис.
После очередной ссоры с семьёй молодой безработный и увлечённый играми Рёхэй Арису встречается с двумя друзьями, оказавшимися в аналогичной ситуации с работой. В районе Сибуя, наблюдая за странным салютом в небе, трое друзей неожиданно оказываются в альтернативной реальности — в пустынном, безлюдном Токио, где привычный мир исчез.
Действие разворачивается в Японии эпохи Мэйдзи, в 1879 году. Хитатори Хидзиката, известный как Бродяга Кэнсин, бывший легендарный убийца, посвятивший себя защите слабых, пытается построить нормальную жизнь рядом с Каoru, своей возлюбленной. Однако его стараниями обрести мир рушатся, когда из тени появляется Энъиси — младший брат Томэ, покойной жены Кэнсина.