Драма с элементами научной фантастики и детективной интриги, где космическое открытие становится зеркалом внутренних драм героев. В ночь, когда астрономы объявляют о существовании второй, идентичной Земле, студентка Рения, ослепленнаяoptimismом от этой новости, попадает в автокатастрофу, которая убивает семью композитора Джона.
Третья и заключительная часть масштабной научно-фантастической саги братьев Вачовски продолжает историю борьбы освобождённого humanity против машин. Фильм развивается по двум параллельным сюжетным линиям. Первая — это отчаянная оборона подземного города Зион, где остатки человечества, включая Морфеуса и его команду, противостоят безжалостному натиску тысяч машин-стражей.