Действие разворачивается в руинах Токио сразу после Второй мировой войны. Главный герой, бывший камикадзе Коити, пытается начать жизнь с чистого листа, но прошлое не отпускает — город в руинах, семья погибла. Судьба сводит его с такой же одинокой девушкой, спасшей младенца во время бомбардировки, и они вместе ищут надежду среди обломков. Но на горизонте появляется новая, непостижимая угроза.
Действие разворачивается в 1614 году, когда Япония, только что объединённая под властью первого сёгуна Токугавы Иэясу, тлеет от внутренних конфликтов. Две древние ninja-деревни, Кога и Ига, десятилетиями ведущие кровавую вражду, становятся пешками в новой политической игре. Их последняя надежда на мир — Генносукэ из клана Кога и Оборо из клана Ига, чья благословённая любовь кажется...