Третья часть культовой саги возвращает зрителя к истокам приключений харизматичного археолога, сосредоточившись на его сложных отношениях с отцом, учёным-оккультистом Генри Джонсом-старшим. Их неожиданное объединение ради общей цели — обнаружения величайшей реликвии христианства, Святого Грааля, — превращается в гонку против нацистов, стремящихся завладеть бессмертием.
Когда Джонатан Ривз теряет зрение, его жизнь погружается в тьму, но медицина предлагает последний шанс — экспериментальное электронное устройство, способное частично восстановить зрение. Операция кажется успешной, однако новый «дар» оборачивается кошмаром: через искусственные глаза Джонатан видит то, что скрыто от других.