«Люди Икс: Тёмный Феникс» завершает сагу о команде мутантов в её классическом составе. События разворачиваются в 1990-х, где Люди Икс, наконец, признаны обществом и работают официальными спасателями. Во время рискованной миссии по спасению астронавтов в космосе Джин Грей погибает, но её тело поглощает древнюю инопланетную сущность — силу Феникса.
Седьмая картина во вселенной «Людей Икс» представляет масштабную историю о выживании и последнем шансе. Действие разворачивается в мрачном будущем, где почти все мутанты истреблены Стражами — смертоносными роботами, созданными для их уничтожения. Остатки команды Икс, возглавляемые Китти Прайд, используют способность Росомахи, чтобы отправить его сознание обратно в 1973 год, в его молодое тело.
Третья и заключительная часть оригинальной трилогии о Людях Икс подводит черту под первой большой историей о мутантах в современном кино. Фильм разворачивается вокруг фундаментального кризиса: команда, долгое время боровшаяся за coexistence с человечеством, сталкивается с угрозой, исходящей изнутри.