Действие разворачивается в руинах Токио сразу после Второй мировой войны. Главный герой, бывший камикадзе Коити, пытается начать жизнь с чистого листа, но прошлое не отпускает — город в руинах, семья погибла. Судьба сводит его с такой же одинокой девушкой, спасшей младенца во время бомбардировки, и они вместе ищут надежду среди обломков. Но на горизонте появляется новая, непостижимая угроза.
Аниме «5 сантиметров в секунду» — это три соприкасающиеся истории, созданные режиссёром Макото Синкаем. Каждая из них исследует, как физическое и эмоциональное расстояние меняет отношения, когда время и обстоятельства разводят людей. Первая часть рассказывает о детской привязанности Такаки и Акари, разлучённых переездами, где их переписка становится единственной нитью, связывающей сердца.