Фильм «Бог не умер 2» развивает тему, поднятую в первой части, перенося её из университетской аудитории в среднюю школу. Главная героиня, учительница истории Эшли, в ответ на вопрос ученика цитирует Библию, что по закону считается пропагандой религии в образовательном учреждении. Её действия вызывают громкий скандал и приводят к увольнению, после чего она решает отстаивать свои права в суде.
В маленьком городке на юге США, где лето 1942 года кажется бесконечным, живет одиннадцатилетний Уилл. Застенчивый и нелюдимый, он проводит все время, наблюдая за кумиром всей округи — звездой местного бейсбольного клуба Динком Дженкинсом. Когда Динк уходит на войну, мир Уилла сжимается до размеров пустого двора.
Фильм переносит в суровую Америку конца XIX века, в эпоху Реконструкции, когда после Гражданской войны на Юг обрушиваются северные банкиры и дельцы, жаждущие земель. Фрэнк и Джесси Джеймс, чьи жизни разрушены наёмным убийством отца и младшего брата, совершают акт мести, который навсегда определяет их судьбу.