Действие этого кайдзю-фильма разворачивается через год после масштабной битвы Годзиллы с восстановленной Механической Годзиллой, которую японские военные создали для защиты от древних чудовищ. Военные и ученые до сих пор хранят на секретной базе остатки биоматериалов Годзиллы, найденные после предыдущих столкновений, планируя использовать их для совершенствования защиты от кайдзю.
