Фильм «Агора» переносит зрителя в Александрию начала V века, когда великий античный мир, ослабленный внутренними раздорами, стоит на пороге глубоких перемен. Римская империя теряет былое могущество, а на её обломках стремительно возвышается новая сила — христианство, которое, опираясь на поддержку простого народа, начинает активно вмешиваться в политику.
Действие разворачивается в мрачном городке оккупированной Польши, где каждая волна «фильтрации» — это поиски и аресты оставшихся в гетто евреев. Десятилетний Алекс, чей отец и дядя Барух тайно содержат его в укрытии за шкафом в квартире на верхнем этаже, пытается сохранить детство среди ужасов. Его мир — это игры на пустынной улице, рискованные прятки с солдатами и чтение вслух «Робинзона...