Дюк, некогда блистательный адвокат крупных преступных группировок, находясь под программой по защите свидетелей, зажигает на роскошной вилле Капри, устраивая безбашенные праздники жизни для своих гостей и превращая будни в яркий Jazz. Однажды под Рождество на виллу приезжает брутальный экс-агент ФБР Лео и переворачивает все вверх дном.
Фильм «Капитан Фантастик» рассказывает историю Бена, бывшего философа, который отказался от общественной жизни и вместе с шестью детьми живёт в изоляции в лесах Тихоокеанского Северо-Запада. Его дети получают блестящее домашнее образование: они свободно говорят на нескольких языках, изучают квантовую физику, читают классиков и ведут активный образ жизни, охотясь и готовя пищу на костре.