Стюарт Литтл уже не тот ребёнок, что был раньше. Он учится в школе, увлекается авиамоделизмом и даже играет в футбольной команде, стараясь жить полной жизнью в большом городе. Однако привычный уклад рушится, когда он знакомится с очаровательной канарейкой по имени Маргало. Между ними завязывается искренняя дружба, но вскоре Маргало раскрывает Стюарту страшную тайну: над городом нависла угроза...
