Действие происходит спустя несколько лет после закрытия отдела по расследованию паранормальных явлений. Фокс Малдер, отстранённый от службы и живущий в уединении, и Дана Скалли, вернувшаяся к медицинской практике, вынужденно отошли от дел. Их спокойствие нарушает срочный вызов: исчезает без вести агент ФБР, и официальное расследование заходит в тупик.
